Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms