Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms