Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms