Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms