Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms