Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms