Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms