Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTC1Q2NKJ3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTC1Q2NKJ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTC1Q2NKJ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTC1Q2NKJ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTC1Q2NKJ3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTC1Q2NKJ3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTC1Q2NKJ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms