Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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