Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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