Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms