Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms