Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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