Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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