Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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