Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms