Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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