Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
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