Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPAQ15257 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPAQ15257 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPAQ15257 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPAQ15257 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPAQ15257 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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PTPAQ15257 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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PTPAQ15257 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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PTPAQ15257 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPAQ15257 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
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