Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EEA1Q15075 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
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