Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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