Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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