Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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