Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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