Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
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COL9A2Q14055 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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COL9A2Q14055 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL9A2Q14055 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL9A2Q14055 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL9A2Q14055 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL9A2Q14055 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL9A2Q14055 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL9A2Q14055 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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COL9A2Q14055 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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