Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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