Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHROOM2Q13796 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms