Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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