Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms