Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3BPQ13352 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms