Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TRAF3Q13114 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TRAF3Q13114 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TRAF3Q13114 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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TRAF3Q13114 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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TRAF3Q13114 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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