Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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TRAF1Q13077 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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TRAF1Q13077 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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