Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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