Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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