Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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