Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms