Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms