Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms