Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms