Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms