Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms