Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms