Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms