Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms