Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms