Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms