Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BEX3Q00994 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms