Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK16Q00536 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms