Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms