Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD1P98174 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms